Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms