Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms