Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Sh2d1bO35324 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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