Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms