Protein–RNA interactions for Protein: F6XK35

Gm21876, Predicted gene, 21876, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21876F6XK35 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm21876F6XK35 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm21876F6XK35 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm21876F6XK35 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21876F6XK35 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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