Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms