Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FancaQ9JL70 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FancaQ9JL70 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FancaQ9JL70 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FancaQ9JL70 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FancaQ9JL70 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FancaQ9JL70 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FancaQ9JL70 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FancaQ9JL70 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FancaQ9JL70 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FancaQ9JL70 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FancaQ9JL70 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FancaQ9JL70 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FancaQ9JL70 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FancaQ9JL70 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FancaQ9JL70 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FancaQ9JL70 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FancaQ9JL70 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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FancaQ9JL70 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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FancaQ9JL70 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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FancaQ9JL70 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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FancaQ9JL70 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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FancaQ9JL70 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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FancaQ9JL70 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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FancaQ9JL70 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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FancaQ9JL70 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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FancaQ9JL70 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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FancaQ9JL70 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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FancaQ9JL70 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms