Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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