Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms