Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms