Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms