Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms