Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms