Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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FgbQ8K0E8 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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FgbQ8K0E8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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FgbQ8K0E8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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FgbQ8K0E8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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FgbQ8K0E8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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FgbQ8K0E8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms