Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrtm1Q8BXQ3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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