Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSL0

Zkscan8, Zinc finger with KRAB and SCAN domains 8, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan8Q8BSL0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan8Q8BSL0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms