Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKD6

Rnf144b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144B, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144bQ8BKD6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms