Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtprdQ64487 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtprdQ64487 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtprdQ64487 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtprdQ64487 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtprdQ64487 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtprdQ64487 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtprdQ64487 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtprdQ64487 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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PtprdQ64487 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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PtprdQ64487 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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