Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samd11Q1RNF8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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