Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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