Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms