Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms