Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms