Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NdnP25233 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms