Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a2P20490 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms