Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GzmbP04187 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms