Protein–RNA interactions for Protein: O55038

Cxcl13, C-X-C motif chemokine 13, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl13O55038 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cxcl13O55038 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cxcl13O55038 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Cxcl13O55038 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Cxcl13O55038 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Cxcl13O55038 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Cxcl13O55038 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Cxcl13O55038 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Cxcl13O55038 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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