Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Kcnk3O35111 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Kcnk3O35111 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnk3O35111 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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