Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms