Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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