Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Nectin3Q9JLB9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Nectin3Q9JLB9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Nectin3Q9JLB9 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Nectin3Q9JLB9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Nectin3Q9JLB9 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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