Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms