Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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Rb1cc1Q9ESK9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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Rb1cc1Q9ESK9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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Rb1cc1Q9ESK9 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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Rb1cc1Q9ESK9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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Rb1cc1Q9ESK9 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
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Rb1cc1Q9ESK9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
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Rb1cc1Q9ESK9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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