Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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