Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms