Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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Rnf144aQ925F3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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