Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms