Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms