Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ccdc17Q8CE13 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ccdc17Q8CE13 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ccdc17Q8CE13 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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