Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms