Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrc2aQ7TSC1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms