Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms