Protein–RNA interactions for Protein: Q60665

Skil, Ski-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkilQ60665 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkilQ60665 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SkilQ60665 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SkilQ60665 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkilQ60665 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkilQ60665 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkilQ60665 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkilQ60665 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SkilQ60665 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkilQ60665 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SkilQ60665 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms