Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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HTR4Q13639 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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HTR4Q13639 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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HTR4Q13639 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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HTR4Q13639 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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HTR4Q13639 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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HTR4Q13639 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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