Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms