Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ccl21cP86793 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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