Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cldn18P56857 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Cldn18P56857 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Cldn18P56857 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Cldn18P56857 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Cldn18P56857 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Cldn18P56857 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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