Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI2P48788 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms