Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01727 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01727 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01727 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01727 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01727 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01727 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01727 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01727 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01727 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01727 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01727 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01727 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01727 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01727 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01727 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01727 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01727 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01727 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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P01727 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01727 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01727 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P01727 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01727 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01727 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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P01727 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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P01727 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01727 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01727 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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P01727 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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P01727 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01727 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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P01727 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01727 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01727 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01727 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01727 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01727 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01727 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01727 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01727 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01727 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01727 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P01727 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P01727 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P01727 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P01727 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P01727 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P01727 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P01727 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P01727 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P01727 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P01727 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P01727 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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