Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01648 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01648 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms